Después del funeral en la Plaza de San Pedro, el cuerpo del Benedicto XVI se desplazó hasta la Cripta de los Papas bajo la Basílica de San Pedro.
El cardenal italiano Giovanni Battista Re, decano del Colegio Cardenalicio, invitó a los presentes a rezar por el alma del Papa emérito.
El arzobispo Georg Gänswein y las cuatro laicas que cuidaron del Papa emérito cantaron y rezaron mientras los restos de Benedicto XVI fueron bendecidos.